euro-pravda.org.ua

Генетики виявили, як утворюються нові структури ДНК.

Механізм взаємодії простих неорганічних полімерів (поліфосфатів) з ДНК може пролити світло на формування «архітектури» геному, проте вчені досі не змогли його пояснити. Тепер, провівши ряд інноваційних експериментів, дослідники виявили, що при певній концентрації іонів магнію ДНК та поліфосфати утворюють нові тонкі структури. Відкриття цієї своєрідної «зони Златовласки» може призвести до розробки нових інструментів контролю за клітинами.
Генетики раскрыли, как образуются новые структуры ДНК.

Полифосфати — це ланцюги фосфатних сполук, які зустрічаються у всіх живих організмах, від бактерій і грибів до рослин і людини. Ці давні молекулярні «універсали» беруть участь у регуляції безлічі клітинних процесів, включаючи згортання крові у людини та реакцію на стрес у бактерій. Найчастіше їх знаходять поряд з хроматином (що є основою хромосом), однак зв'язок цих простих за будовою неорганічних полімерів з ДНК довгий час залишалася загадкою.

У бактеріальних клітинах полифосфати можуть формувати особливі конденсатори (безмембранні краплі) в області нуклеоїда, тобто там, де зберігається генетичний матеріал. Такі клітини зазвичай збагачені іонами магнію. Саме вони, як з'ясували автори дослідження, опублікованого в журналі Nature Communications, відіграють ключову роль у з'єднанні полифосфатів і ДНК під час формування нових структур.

Команда вчених під керівництвом Лізи Рекі (Lisa Racki) та Ашока Деніза (Ashok Deniz) спостерігала цей ефект, застосувавши методи флуоресцентної мікроскопії (молекули полифосфатів і ДНК позначалися барвниками) та електронної крітомографії (щоб детально розглянути структуру). Цей підхід дозволив зафіксувати, як саме нитки ДНК прилягають до поверхні полифосфатних конденсатів.

Результати показали, що в присутності іонів магнію довгі ланцюги полифосфатів самостійно збиралися в краплі, однак оболонка формувалася лише при певних концентраціях: при занадто низькому або високому вмісті іонів магнію процес переривався. Отже, змінити «поведінку» ДНК і розмір полифосфатних конденсатів могли навіть незначні концентрації іонів магнію. Довгі ланцюги ДНК при цьому зменшували розмір крапель, запобігаючи їх злиттю.

Відкриття дозволяє по-новому поглянути на роль полифосфатів в компоновці ДНК, оскільки від їх присутності може змінюватися форма і функція хроматину. Вчені зазначили, що описаний ними механізм, ймовірно, широко поширений і не обмежується бактеріальними клітинами: магній і ДНК зустрічаються повсюдно. Як і полифосфати.

Оскільки полифосфатні конденсатори — це підходящий варіант наноємностей для упаковки лікарських речовин, результати наукової роботи знайдуть застосування в біоінженерії, а розуміння того, що оболонка з ДНК впливає на їх форму і поведінку, дозволить краще керувати структурою подібних комплексів.

Щоб з'ясувати, чи застосовний цей універсальний механізм до ряду інших молекулярних взаємодій у клітинах, вчені мають намір провести подальші експерименти, в яких до ДНК і полифосфатів додадуть різні білки та інші компоненти. Оскільки такі прості полімери, як полифосфати, в присутності магнію та ДНК формують структури, що впливають на конфігурацію генетичного матеріалу та клітинні функції, результати майбутніх досліджень, ймовірно, будуть вражаючими.